Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Q8

Colec12, Collectin-12, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec12Q8K4Q8 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Colec12Q8K4Q8 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Colec12Q8K4Q8 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Colec12Q8K4Q8 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Colec12Q8K4Q8 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Colec12Q8K4Q8 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Colec12Q8K4Q8 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Colec12Q8K4Q8 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Colec12Q8K4Q8 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Colec12Q8K4Q8 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Colec12Q8K4Q8 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Colec12Q8K4Q8 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Colec12Q8K4Q8 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Colec12Q8K4Q8 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Colec12Q8K4Q8 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Colec12Q8K4Q8 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Colec12Q8K4Q8 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Colec12Q8K4Q8 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Colec12Q8K4Q8 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Colec12Q8K4Q8 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Colec12Q8K4Q8 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Colec12Q8K4Q8 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Colec12Q8K4Q8 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Colec12Q8K4Q8 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Colec12Q8K4Q8 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Colec12Q8K4Q8 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Colec12Q8K4Q8 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Colec12Q8K4Q8 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Colec12Q8K4Q8 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Colec12Q8K4Q8 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Colec12Q8K4Q8 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Colec12Q8K4Q8 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Colec12Q8K4Q8 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Colec12Q8K4Q8 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Colec12Q8K4Q8 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Colec12Q8K4Q8 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Colec12Q8K4Q8 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Colec12Q8K4Q8 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Colec12Q8K4Q8 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Colec12Q8K4Q8 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Colec12Q8K4Q8 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Colec12Q8K4Q8 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Colec12Q8K4Q8 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Colec12Q8K4Q8 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Colec12Q8K4Q8 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Colec12Q8K4Q8 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Colec12Q8K4Q8 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Colec12Q8K4Q8 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Colec12Q8K4Q8 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Colec12Q8K4Q8 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Colec12Q8K4Q8 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Colec12Q8K4Q8 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Colec12Q8K4Q8 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Colec12Q8K4Q8 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Colec12Q8K4Q8 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Colec12Q8K4Q8 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Colec12Q8K4Q8 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Colec12Q8K4Q8 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Colec12Q8K4Q8 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Colec12Q8K4Q8 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Colec12Q8K4Q8 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Colec12Q8K4Q8 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Colec12Q8K4Q8 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Colec12Q8K4Q8 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Colec12Q8K4Q8 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Colec12Q8K4Q8 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Colec12Q8K4Q8 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Colec12Q8K4Q8 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Colec12Q8K4Q8 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Colec12Q8K4Q8 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Colec12Q8K4Q8 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Colec12Q8K4Q8 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Colec12Q8K4Q8 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Colec12Q8K4Q8 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Colec12Q8K4Q8 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Colec12Q8K4Q8 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Colec12Q8K4Q8 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Colec12Q8K4Q8 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Colec12Q8K4Q8 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Colec12Q8K4Q8 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Colec12Q8K4Q8 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Colec12Q8K4Q8 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Colec12Q8K4Q8 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Colec12Q8K4Q8 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Colec12Q8K4Q8 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Colec12Q8K4Q8 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Colec12Q8K4Q8 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Colec12Q8K4Q8 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Colec12Q8K4Q8 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Colec12Q8K4Q8 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Colec12Q8K4Q8 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Colec12Q8K4Q8 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Colec12Q8K4Q8 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Colec12Q8K4Q8 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Colec12Q8K4Q8 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Colec12Q8K4Q8 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Colec12Q8K4Q8 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Colec12Q8K4Q8 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Colec12Q8K4Q8 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Colec12Q8K4Q8 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms