Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms