Protein–RNA interactions for Protein: Q8K310

Matr3, Matrin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 846 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Matr3Q8K310 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Matr3Q8K310 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Matr3Q8K310 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Matr3Q8K310 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Matr3Q8K310 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Matr3Q8K310 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Matr3Q8K310 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Matr3Q8K310 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Matr3Q8K310 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Matr3Q8K310 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Matr3Q8K310 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Matr3Q8K310 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Matr3Q8K310 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Matr3Q8K310 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Matr3Q8K310 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Matr3Q8K310 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Matr3Q8K310 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Matr3Q8K310 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Matr3Q8K310 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Matr3Q8K310 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Matr3Q8K310 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Matr3Q8K310 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Matr3Q8K310 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Matr3Q8K310 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Matr3Q8K310 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Matr3Q8K310 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Matr3Q8K310 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Matr3Q8K310 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Matr3Q8K310 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Matr3Q8K310 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Matr3Q8K310 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Matr3Q8K310 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Matr3Q8K310 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Matr3Q8K310 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Matr3Q8K310 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
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Matr3Q8K310 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Matr3Q8K310 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Matr3Q8K310 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Matr3Q8K310 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Matr3Q8K310 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Matr3Q8K310 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Matr3Q8K310 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Matr3Q8K310 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Matr3Q8K310 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Matr3Q8K310 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Matr3Q8K310 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Matr3Q8K310 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Matr3Q8K310 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Matr3Q8K310 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Matr3Q8K310 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Matr3Q8K310 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Matr3Q8K310 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Matr3Q8K310 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Matr3Q8K310 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Matr3Q8K310 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Matr3Q8K310 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Matr3Q8K310 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Matr3Q8K310 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Matr3Q8K310 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Matr3Q8K310 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Matr3Q8K310 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Matr3Q8K310 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Matr3Q8K310 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Matr3Q8K310 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Matr3Q8K310 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Matr3Q8K310 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Matr3Q8K310 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Matr3Q8K310 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Matr3Q8K310 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Matr3Q8K310 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Matr3Q8K310 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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Matr3Q8K310 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Matr3Q8K310 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Matr3Q8K310 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Matr3Q8K310 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Matr3Q8K310 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Matr3Q8K310 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Matr3Q8K310 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Matr3Q8K310 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Matr3Q8K310 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Matr3Q8K310 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Matr3Q8K310 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Matr3Q8K310 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Matr3Q8K310 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Matr3Q8K310 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Matr3Q8K310 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Matr3Q8K310 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Matr3Q8K310 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Matr3Q8K310 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Matr3Q8K310 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Matr3Q8K310 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Matr3Q8K310 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms