Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGC6

Rbm28, RNA-binding protein 28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 750 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm28Q8CGC6 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms