Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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