Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
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Usp20Q8C6M1 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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