Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usp38Q8BW70 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp38Q8BW70 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp38Q8BW70 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Usp38Q8BW70 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Usp38Q8BW70 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Usp38Q8BW70 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Usp38Q8BW70 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Usp38Q8BW70 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Usp38Q8BW70 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Usp38Q8BW70 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Usp38Q8BW70 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms