Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcl3Q8BVF2 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms