Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP99

UPF0500 protein C1orf216 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BP99 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8BP99 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8BP99 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8BP99 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8BP99 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8BP99 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8BP99 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8BP99 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8BP99 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8BP99 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8BP99 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Q8BP99 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8BP99 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8BP99 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8BP99 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8BP99 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8BP99 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8BP99 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8BP99 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8BP99 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8BP99 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8BP99 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8BP99 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8BP99 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8BP99 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8BP99 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8BP99 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8BP99 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8BP99 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8BP99 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8BP99 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8BP99 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8BP99 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8BP99 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8BP99 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8BP99 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8BP99 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8BP99 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8BP99 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8BP99 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8BP99 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8BP99 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8BP99 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8BP99 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8BP99 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8BP99 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8BP99 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8BP99 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8BP99 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8BP99 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8BP99 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8BP99 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8BP99 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8BP99 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8BP99 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8BP99 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8BP99 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8BP99 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8BP99 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8BP99 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8BP99 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8BP99 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8BP99 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8BP99 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8BP99 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8BP99 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8BP99 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8BP99 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8BP99 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8BP99 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8BP99 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8BP99 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8BP99 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8BP99 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8BP99 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8BP99 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8BP99 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8BP99 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8BP99 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8BP99 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8BP99 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8BP99 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8BP99 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8BP99 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8BP99 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8BP99 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8BP99 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8BP99 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8BP99 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8BP99 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8BP99 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8BP99 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8BP99 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8BP99 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8BP99 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8BP99 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8BP99 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8BP99 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8BP99 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8BP99 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms