Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms