Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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