Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Avl9Q80U56 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Avl9Q80U56 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Avl9Q80U56 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Avl9Q80U56 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Avl9Q80U56 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Avl9Q80U56 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Avl9Q80U56 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Avl9Q80U56 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Avl9Q80U56 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Avl9Q80U56 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Avl9Q80U56 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Avl9Q80U56 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Avl9Q80U56 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Avl9Q80U56 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Avl9Q80U56 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Avl9Q80U56 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Avl9Q80U56 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Avl9Q80U56 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Avl9Q80U56 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Avl9Q80U56 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Avl9Q80U56 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Avl9Q80U56 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Avl9Q80U56 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Avl9Q80U56 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Avl9Q80U56 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Avl9Q80U56 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Avl9Q80U56 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Avl9Q80U56 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Avl9Q80U56 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Avl9Q80U56 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Avl9Q80U56 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Avl9Q80U56 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Avl9Q80U56 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Avl9Q80U56 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Avl9Q80U56 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Avl9Q80U56 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Avl9Q80U56 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Avl9Q80U56 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Avl9Q80U56 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Avl9Q80U56 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Avl9Q80U56 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Avl9Q80U56 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Avl9Q80U56 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Avl9Q80U56 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Avl9Q80U56 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Avl9Q80U56 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Avl9Q80U56 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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