Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNB8

Sbno2, Protein strawberry notch homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno2Q7TNB8 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sbno2Q7TNB8 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sbno2Q7TNB8 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sbno2Q7TNB8 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sbno2Q7TNB8 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sbno2Q7TNB8 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sbno2Q7TNB8 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sbno2Q7TNB8 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sbno2Q7TNB8 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sbno2Q7TNB8 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sbno2Q7TNB8 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sbno2Q7TNB8 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sbno2Q7TNB8 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sbno2Q7TNB8 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sbno2Q7TNB8 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sbno2Q7TNB8 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sbno2Q7TNB8 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sbno2Q7TNB8 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sbno2Q7TNB8 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sbno2Q7TNB8 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sbno2Q7TNB8 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sbno2Q7TNB8 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sbno2Q7TNB8 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sbno2Q7TNB8 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sbno2Q7TNB8 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sbno2Q7TNB8 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sbno2Q7TNB8 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sbno2Q7TNB8 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sbno2Q7TNB8 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sbno2Q7TNB8 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sbno2Q7TNB8 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sbno2Q7TNB8 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sbno2Q7TNB8 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sbno2Q7TNB8 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sbno2Q7TNB8 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sbno2Q7TNB8 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sbno2Q7TNB8 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sbno2Q7TNB8 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sbno2Q7TNB8 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sbno2Q7TNB8 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sbno2Q7TNB8 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sbno2Q7TNB8 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sbno2Q7TNB8 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sbno2Q7TNB8 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sbno2Q7TNB8 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sbno2Q7TNB8 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sbno2Q7TNB8 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sbno2Q7TNB8 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sbno2Q7TNB8 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Sbno2Q7TNB8 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sbno2Q7TNB8 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sbno2Q7TNB8 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sbno2Q7TNB8 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sbno2Q7TNB8 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sbno2Q7TNB8 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sbno2Q7TNB8 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sbno2Q7TNB8 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sbno2Q7TNB8 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sbno2Q7TNB8 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Sbno2Q7TNB8 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sbno2Q7TNB8 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sbno2Q7TNB8 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sbno2Q7TNB8 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Sbno2Q7TNB8 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sbno2Q7TNB8 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sbno2Q7TNB8 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sbno2Q7TNB8 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sbno2Q7TNB8 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sbno2Q7TNB8 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sbno2Q7TNB8 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sbno2Q7TNB8 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sbno2Q7TNB8 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Sbno2Q7TNB8 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sbno2Q7TNB8 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sbno2Q7TNB8 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Sbno2Q7TNB8 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sbno2Q7TNB8 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sbno2Q7TNB8 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sbno2Q7TNB8 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sbno2Q7TNB8 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sbno2Q7TNB8 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sbno2Q7TNB8 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sbno2Q7TNB8 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Sbno2Q7TNB8 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sbno2Q7TNB8 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Sbno2Q7TNB8 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sbno2Q7TNB8 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sbno2Q7TNB8 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sbno2Q7TNB8 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sbno2Q7TNB8 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sbno2Q7TNB8 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sbno2Q7TNB8 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sbno2Q7TNB8 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sbno2Q7TNB8 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sbno2Q7TNB8 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sbno2Q7TNB8 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Sbno2Q7TNB8 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Sbno2Q7TNB8 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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