Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV9

Mdc1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdc1Q5PSV9 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mdc1Q5PSV9 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mdc1Q5PSV9 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mdc1Q5PSV9 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Mdc1Q5PSV9 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mdc1Q5PSV9 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mdc1Q5PSV9 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mdc1Q5PSV9 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mdc1Q5PSV9 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mdc1Q5PSV9 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mdc1Q5PSV9 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mdc1Q5PSV9 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mdc1Q5PSV9 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mdc1Q5PSV9 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mdc1Q5PSV9 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mdc1Q5PSV9 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mdc1Q5PSV9 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mdc1Q5PSV9 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mdc1Q5PSV9 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mdc1Q5PSV9 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mdc1Q5PSV9 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mdc1Q5PSV9 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Mdc1Q5PSV9 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Mdc1Q5PSV9 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mdc1Q5PSV9 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mdc1Q5PSV9 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mdc1Q5PSV9 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mdc1Q5PSV9 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mdc1Q5PSV9 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mdc1Q5PSV9 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Mdc1Q5PSV9 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Mdc1Q5PSV9 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mdc1Q5PSV9 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Mdc1Q5PSV9 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mdc1Q5PSV9 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mdc1Q5PSV9 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mdc1Q5PSV9 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mdc1Q5PSV9 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mdc1Q5PSV9 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mdc1Q5PSV9 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mdc1Q5PSV9 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mdc1Q5PSV9 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mdc1Q5PSV9 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mdc1Q5PSV9 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mdc1Q5PSV9 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mdc1Q5PSV9 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mdc1Q5PSV9 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mdc1Q5PSV9 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mdc1Q5PSV9 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mdc1Q5PSV9 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mdc1Q5PSV9 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Mdc1Q5PSV9 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mdc1Q5PSV9 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Mdc1Q5PSV9 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Mdc1Q5PSV9 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mdc1Q5PSV9 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mdc1Q5PSV9 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mdc1Q5PSV9 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mdc1Q5PSV9 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mdc1Q5PSV9 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mdc1Q5PSV9 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mdc1Q5PSV9 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mdc1Q5PSV9 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mdc1Q5PSV9 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mdc1Q5PSV9 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Mdc1Q5PSV9 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mdc1Q5PSV9 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mdc1Q5PSV9 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mdc1Q5PSV9 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mdc1Q5PSV9 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mdc1Q5PSV9 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mdc1Q5PSV9 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Mdc1Q5PSV9 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mdc1Q5PSV9 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Mdc1Q5PSV9 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Mdc1Q5PSV9 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mdc1Q5PSV9 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mdc1Q5PSV9 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mdc1Q5PSV9 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mdc1Q5PSV9 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mdc1Q5PSV9 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Mdc1Q5PSV9 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Mdc1Q5PSV9 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mdc1Q5PSV9 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mdc1Q5PSV9 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mdc1Q5PSV9 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mdc1Q5PSV9 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mdc1Q5PSV9 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mdc1Q5PSV9 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mdc1Q5PSV9 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mdc1Q5PSV9 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mdc1Q5PSV9 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mdc1Q5PSV9 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mdc1Q5PSV9 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mdc1Q5PSV9 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mdc1Q5PSV9 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mdc1Q5PSV9 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mdc1Q5PSV9 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mdc1Q5PSV9 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Mdc1Q5PSV9 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms