Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZT31

Snx25, Sorting nexin-25, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx25Q3ZT31 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Snx25Q3ZT31 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Snx25Q3ZT31 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Snx25Q3ZT31 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Snx25Q3ZT31 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Snx25Q3ZT31 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Snx25Q3ZT31 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Snx25Q3ZT31 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Snx25Q3ZT31 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Snx25Q3ZT31 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Snx25Q3ZT31 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Snx25Q3ZT31 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Snx25Q3ZT31 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Snx25Q3ZT31 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Snx25Q3ZT31 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Snx25Q3ZT31 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Snx25Q3ZT31 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Snx25Q3ZT31 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Snx25Q3ZT31 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Snx25Q3ZT31 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Snx25Q3ZT31 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Snx25Q3ZT31 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Snx25Q3ZT31 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Snx25Q3ZT31 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Snx25Q3ZT31 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Snx25Q3ZT31 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Snx25Q3ZT31 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Snx25Q3ZT31 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Snx25Q3ZT31 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Snx25Q3ZT31 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Snx25Q3ZT31 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Snx25Q3ZT31 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Snx25Q3ZT31 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Snx25Q3ZT31 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Snx25Q3ZT31 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Snx25Q3ZT31 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Snx25Q3ZT31 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Snx25Q3ZT31 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Snx25Q3ZT31 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Snx25Q3ZT31 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Snx25Q3ZT31 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Snx25Q3ZT31 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Snx25Q3ZT31 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Snx25Q3ZT31 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Snx25Q3ZT31 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Snx25Q3ZT31 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Snx25Q3ZT31 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Snx25Q3ZT31 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Snx25Q3ZT31 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Snx25Q3ZT31 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Snx25Q3ZT31 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Snx25Q3ZT31 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Snx25Q3ZT31 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Snx25Q3ZT31 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Snx25Q3ZT31 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Snx25Q3ZT31 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Snx25Q3ZT31 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Snx25Q3ZT31 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Snx25Q3ZT31 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms