Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

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Length 621 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc185Q3V118 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc185Q3V118 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc185Q3V118 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Ccdc185Q3V118 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc185Q3V118 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc185Q3V118 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc185Q3V118 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc185Q3V118 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc185Q3V118 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc185Q3V118 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc185Q3V118 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc185Q3V118 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc185Q3V118 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Ccdc185Q3V118 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc185Q3V118 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Ccdc185Q3V118 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Ccdc185Q3V118 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc185Q3V118 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Ccdc185Q3V118 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc185Q3V118 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc185Q3V118 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc185Q3V118 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc185Q3V118 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc185Q3V118 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc185Q3V118 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc185Q3V118 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc185Q3V118 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc185Q3V118 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc185Q3V118 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc185Q3V118 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc185Q3V118 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc185Q3V118 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Ccdc185Q3V118 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc185Q3V118 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc185Q3V118 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Ccdc185Q3V118 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Ccdc185Q3V118 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc185Q3V118 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc185Q3V118 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc185Q3V118 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Ccdc185Q3V118 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc185Q3V118 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Ccdc185Q3V118 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Ccdc185Q3V118 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc185Q3V118 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc185Q3V118 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc185Q3V118 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc185Q3V118 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc185Q3V118 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc185Q3V118 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc185Q3V118 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc185Q3V118 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc185Q3V118 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc185Q3V118 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc185Q3V118 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc185Q3V118 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc185Q3V118 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc185Q3V118 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc185Q3V118 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc185Q3V118 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc185Q3V118 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc185Q3V118 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc185Q3V118 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc185Q3V118 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc185Q3V118 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc185Q3V118 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc185Q3V118 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc185Q3V118 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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