Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc43Q3V0L5 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc43Q3V0L5 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc43Q3V0L5 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc43Q3V0L5 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc43Q3V0L5 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc43Q3V0L5 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc43Q3V0L5 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc43Q3V0L5 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc43Q3V0L5 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc43Q3V0L5 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc43Q3V0L5 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc43Q3V0L5 Ccdc7a-202ENSMUST00000108747 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc43Q3V0L5 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc43Q3V0L5 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc43Q3V0L5 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc43Q3V0L5 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc43Q3V0L5 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc43Q3V0L5 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc43Q3V0L5 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc43Q3V0L5 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc43Q3V0L5 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc43Q3V0L5 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc43Q3V0L5 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc43Q3V0L5 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc43Q3V0L5 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc43Q3V0L5 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc43Q3V0L5 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc43Q3V0L5 Cep97-204ENSMUST00000121129 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc43Q3V0L5 1700023C21Rik-201ENSMUST00000143247 389 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc43Q3V0L5 Gm22588-201ENSMUST00000157510 140 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc43Q3V0L5 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc43Q3V0L5 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc43Q3V0L5 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc43Q3V0L5 AC154595.1-201ENSMUST00000225533 1059 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc43Q3V0L5 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc43Q3V0L5 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc43Q3V0L5 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc43Q3V0L5 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc43Q3V0L5 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc43Q3V0L5 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc43Q3V0L5 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc43Q3V0L5 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc43Q3V0L5 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc43Q3V0L5 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc43Q3V0L5 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrc43Q3V0L5 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrc43Q3V0L5 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrc43Q3V0L5 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrc43Q3V0L5 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrc43Q3V0L5 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrc43Q3V0L5 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrc43Q3V0L5 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrc43Q3V0L5 Gm39526-201ENSMUST00000208925 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrc43Q3V0L5 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrc43Q3V0L5 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrc43Q3V0L5 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrc43Q3V0L5 Mir1192-201ENSMUST00000116976 121 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrc43Q3V0L5 Btf3-205ENSMUST00000152704 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrc43Q3V0L5 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrc43Q3V0L5 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrc43Q3V0L5 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrc43Q3V0L5 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
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Lrrc43Q3V0L5 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrc43Q3V0L5 Ms4a4b-201ENSMUST00000035258 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrc43Q3V0L5 Zfp865-202ENSMUST00000076791 1129 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrc43Q3V0L5 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrc43Q3V0L5 Obp1b-201ENSMUST00000088198 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrc43Q3V0L5 BC061237-201ENSMUST00000096899 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrc43Q3V0L5 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrc43Q3V0L5 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrc43Q3V0L5 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrc43Q3V0L5 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrc43Q3V0L5 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrc43Q3V0L5 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrc43Q3V0L5 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrc43Q3V0L5 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrc43Q3V0L5 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrc43Q3V0L5 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrc43Q3V0L5 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrc43Q3V0L5 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrc43Q3V0L5 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrc43Q3V0L5 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Lrrc43Q3V0L5 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Lrrc43Q3V0L5 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Lrrc43Q3V0L5 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrc43Q3V0L5 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrc43Q3V0L5 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrc43Q3V0L5 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrc43Q3V0L5 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrc43Q3V0L5 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrc43Q3V0L5 4930599A14Rik-201ENSMUST00000186724 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrc43Q3V0L5 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrc43Q3V0L5 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrc43Q3V0L5 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrc43Q3V0L5 Nme5-201ENSMUST00000079287 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrc43Q3V0L5 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrc43Q3V0L5 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms