Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR9

Sbspon, Somatomedin-B and thrombospondin type-1 domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsponQ3UPR9 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
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