Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
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D13Ertd608eQ3UPR8 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
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D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
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D13Ertd608eQ3UPR8 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
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