Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q3U6N9 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q3U6N9 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q3U6N9 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q3U6N9 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q3U6N9 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q3U6N9 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q3U6N9 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q3U6N9 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q3U6N9 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms