Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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