Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
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