Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms