Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Kcnma1Q08460 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnma1Q08460 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Kcnma1Q08460 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Kcnma1Q08460 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnma1Q08460 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Kcnma1Q08460 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnma1Q08460 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Kcnma1Q08460 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Kcnma1Q08460 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Kcnma1Q08460 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Kcnma1Q08460 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Kcnma1Q08460 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Kcnma1Q08460 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Kcnma1Q08460 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnma1Q08460 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnma1Q08460 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnma1Q08460 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnma1Q08460 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnma1Q08460 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnma1Q08460 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnma1Q08460 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnma1Q08460 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnma1Q08460 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnma1Q08460 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnma1Q08460 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnma1Q08460 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnma1Q08460 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnma1Q08460 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnma1Q08460 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnma1Q08460 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnma1Q08460 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms