Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms