Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms