Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gjb4Q02738 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Gjb4Q02738 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gjb4Q02738 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gjb4Q02738 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gjb4Q02738 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gjb4Q02738 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gjb4Q02738 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gjb4Q02738 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gjb4Q02738 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gjb4Q02738 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gjb4Q02738 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gjb4Q02738 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gjb4Q02738 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gjb4Q02738 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gjb4Q02738 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gjb4Q02738 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb4Q02738 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb4Q02738 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb4Q02738 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb4Q02738 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb4Q02738 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb4Q02738 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb4Q02738 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb4Q02738 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb4Q02738 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb4Q02738 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb4Q02738 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb4Q02738 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb4Q02738 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb4Q02738 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb4Q02738 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb4Q02738 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb4Q02738 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb4Q02738 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb4Q02738 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb4Q02738 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb4Q02738 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb4Q02738 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb4Q02738 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb4Q02738 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb4Q02738 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb4Q02738 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb4Q02738 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb4Q02738 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb4Q02738 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb4Q02738 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb4Q02738 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb4Q02738 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gjb4Q02738 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gjb4Q02738 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gjb4Q02738 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gjb4Q02738 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gjb4Q02738 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gjb4Q02738 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gjb4Q02738 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gjb4Q02738 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gjb4Q02738 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gjb4Q02738 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gjb4Q02738 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gjb4Q02738 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gjb4Q02738 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gjb4Q02738 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gjb4Q02738 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gjb4Q02738 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gjb4Q02738 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gjb4Q02738 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gjb4Q02738 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gjb4Q02738 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gjb4Q02738 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms