Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms