Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms