Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nbr1P97432 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nbr1P97432 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nbr1P97432 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nbr1P97432 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nbr1P97432 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nbr1P97432 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nbr1P97432 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nbr1P97432 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nbr1P97432 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nbr1P97432 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nbr1P97432 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nbr1P97432 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nbr1P97432 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nbr1P97432 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nbr1P97432 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nbr1P97432 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nbr1P97432 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nbr1P97432 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nbr1P97432 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nbr1P97432 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nbr1P97432 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nbr1P97432 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nbr1P97432 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nbr1P97432 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nbr1P97432 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nbr1P97432 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nbr1P97432 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nbr1P97432 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nbr1P97432 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nbr1P97432 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nbr1P97432 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nbr1P97432 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nbr1P97432 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nbr1P97432 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nbr1P97432 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nbr1P97432 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nbr1P97432 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nbr1P97432 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nbr1P97432 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nbr1P97432 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nbr1P97432 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nbr1P97432 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nbr1P97432 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Nbr1P97432 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nbr1P97432 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nbr1P97432 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nbr1P97432 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nbr1P97432 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nbr1P97432 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nbr1P97432 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nbr1P97432 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms