Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms