Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Usp9xP70398 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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