Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snap25P60879 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snap25P60879 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snap25P60879 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snap25P60879 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snap25P60879 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snap25P60879 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms