Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms