Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc10P31257 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc10P31257 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc10P31257 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc10P31257 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc10P31257 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc10P31257 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc10P31257 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc10P31257 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc10P31257 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc10P31257 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc10P31257 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc10P31257 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc10P31257 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc10P31257 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc10P31257 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc10P31257 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc10P31257 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc10P31257 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc10P31257 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc10P31257 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc10P31257 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc10P31257 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc10P31257 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc10P31257 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc10P31257 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc10P31257 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc10P31257 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc10P31257 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc10P31257 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc10P31257 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc10P31257 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc10P31257 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc10P31257 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc10P31257 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc10P31257 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc10P31257 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc10P31257 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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Hoxc10P31257 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Hoxc10P31257 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Hoxc10P31257 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Hoxc10P31257 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc10P31257 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc10P31257 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc10P31257 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc10P31257 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc10P31257 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Hoxc10P31257 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc10P31257 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc10P31257 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc10P31257 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc10P31257 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc10P31257 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc10P31257 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Hoxc10P31257 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Hoxc10P31257 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Hoxc10P31257 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxc10P31257 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxc10P31257 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxc10P31257 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxc10P31257 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxc10P31257 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxc10P31257 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Hoxc10P31257 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxc10P31257 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Hoxc10P31257 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxc10P31257 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxc10P31257 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxc10P31257 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxc10P31257 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxc10P31257 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxc10P31257 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxc10P31257 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxc10P31257 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxc10P31257 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxc10P31257 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxc10P31257 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxc10P31257 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxc10P31257 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc10P31257 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc10P31257 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc10P31257 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc10P31257 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc10P31257 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc10P31257 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc10P31257 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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