Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Ssxb9-201ENSMUST00000115584 879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Gm42452-201ENSMUST00000199749 617 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Rnase2a-201ENSMUST00000061936 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Olfr816-201ENSMUST00000071605 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Gm4806-201ENSMUST00000222704 1690 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Gm16147-201ENSMUST00000162143 373 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Gm20659-201ENSMUST00000176599 604 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 5430434I15Rik-201ENSMUST00000197658 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Olfr1295-201ENSMUST00000207283 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Gm45488-201ENSMUST00000210747 371 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Gm45554-202ENSMUST00000210964 1090 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Gm19269-201ENSMUST00000211401 804 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Gm19572-201ENSMUST00000214326 338 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 AC133517.2-201ENSMUST00000226820 690 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Pdcl2-201ENSMUST00000031145 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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