Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
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