Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ms4a2P20490 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ms4a2P20490 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ms4a2P20490 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ms4a2P20490 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ms4a2P20490 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ms4a2P20490 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ms4a2P20490 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ms4a2P20490 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ms4a2P20490 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ms4a2P20490 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ms4a2P20490 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ms4a2P20490 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ms4a2P20490 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ms4a2P20490 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ms4a2P20490 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ms4a2P20490 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ms4a2P20490 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms