Protein–RNA interactions for Protein: P18529

Ig heavy chain V region 5-76, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18529 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
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P18529 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P18529 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P18529 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P18529 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P18529 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P18529 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P18529 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P18529 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P18529 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
P18529 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P18529 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
P18529 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P18529 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P18529 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P18529 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P18529 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P18529 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P18529 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P18529 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P18529 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
P18529 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P18529 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P18529 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P18529 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P18529 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P18529 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
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P18529 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P18529 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P18529 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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P18529 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
P18529 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P18529 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P18529 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
P18529 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P18529 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P18529 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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P18529 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P18529 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
P18529 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
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P18529 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
P18529 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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P18529 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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P18529 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P18529 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P18529 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
P18529 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P18529 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P18529 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P18529 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P18529 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P18529 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P18529 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
P18529 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC11□□□□□ -0.65
P18529 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P18529 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC11□□□□□ -0.65
P18529 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
P18529 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
P18529 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P18529 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
P18529 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC11□□□□□ -0.65
P18529 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P18529 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P18529 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
P18529 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P18529 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC11□□□□□ -0.65
P18529 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P18529 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P18529 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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