Protein–RNA interactions for Protein: O89090

Sp1, Transcription factor Sp1, mousemouse

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Length 784 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp1O89090 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sp1O89090 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Sp1O89090 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Sp1O89090 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sp1O89090 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sp1O89090 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sp1O89090 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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