Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms