Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SlkO54988 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SlkO54988 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SlkO54988 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SlkO54988 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SlkO54988 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SlkO54988 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SlkO54988 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SlkO54988 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SlkO54988 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SlkO54988 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SlkO54988 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SlkO54988 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SlkO54988 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SlkO54988 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SlkO54988 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SlkO54988 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SlkO54988 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SlkO54988 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SlkO54988 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SlkO54988 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SlkO54988 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SlkO54988 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SlkO54988 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SlkO54988 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SlkO54988 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SlkO54988 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SlkO54988 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SlkO54988 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SlkO54988 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SlkO54988 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SlkO54988 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SlkO54988 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SlkO54988 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SlkO54988 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SlkO54988 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SlkO54988 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SlkO54988 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SlkO54988 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SlkO54988 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SlkO54988 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SlkO54988 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SlkO54988 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SlkO54988 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SlkO54988 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SlkO54988 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SlkO54988 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SlkO54988 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SlkO54988 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SlkO54988 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SlkO54988 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SlkO54988 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SlkO54988 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SlkO54988 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SlkO54988 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SlkO54988 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SlkO54988 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SlkO54988 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SlkO54988 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SlkO54988 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SlkO54988 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SlkO54988 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SlkO54988 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SlkO54988 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SlkO54988 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SlkO54988 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SlkO54988 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SlkO54988 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SlkO54988 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SlkO54988 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SlkO54988 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SlkO54988 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SlkO54988 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SlkO54988 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SlkO54988 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SlkO54988 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SlkO54988 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SlkO54988 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SlkO54988 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SlkO54988 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SlkO54988 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SlkO54988 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SlkO54988 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SlkO54988 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SlkO54988 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SlkO54988 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SlkO54988 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SlkO54988 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SlkO54988 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SlkO54988 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SlkO54988 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SlkO54988 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SlkO54988 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SlkO54988 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SlkO54988 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SlkO54988 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SlkO54988 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SlkO54988 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SlkO54988 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SlkO54988 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms