Protein–RNA interactions for Protein: O54909

Rdh16, Cis-retinol androgen dehydrogenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16O54909 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rdh16O54909 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rdh16O54909 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rdh16O54909 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rdh16O54909 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rdh16O54909 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rdh16O54909 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rdh16O54909 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rdh16O54909 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rdh16O54909 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rdh16O54909 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rdh16O54909 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rdh16O54909 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rdh16O54909 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rdh16O54909 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rdh16O54909 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rdh16O54909 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rdh16O54909 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rdh16O54909 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rdh16O54909 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rdh16O54909 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rdh16O54909 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rdh16O54909 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rdh16O54909 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rdh16O54909 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rdh16O54909 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rdh16O54909 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rdh16O54909 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rdh16O54909 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rdh16O54909 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rdh16O54909 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rdh16O54909 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rdh16O54909 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rdh16O54909 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rdh16O54909 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rdh16O54909 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rdh16O54909 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rdh16O54909 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rdh16O54909 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rdh16O54909 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rdh16O54909 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rdh16O54909 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rdh16O54909 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rdh16O54909 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rdh16O54909 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rdh16O54909 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rdh16O54909 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rdh16O54909 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rdh16O54909 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rdh16O54909 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rdh16O54909 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rdh16O54909 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rdh16O54909 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rdh16O54909 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rdh16O54909 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rdh16O54909 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rdh16O54909 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rdh16O54909 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rdh16O54909 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rdh16O54909 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rdh16O54909 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rdh16O54909 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rdh16O54909 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rdh16O54909 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rdh16O54909 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rdh16O54909 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rdh16O54909 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rdh16O54909 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rdh16O54909 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rdh16O54909 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rdh16O54909 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rdh16O54909 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rdh16O54909 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rdh16O54909 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rdh16O54909 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rdh16O54909 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rdh16O54909 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rdh16O54909 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rdh16O54909 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rdh16O54909 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rdh16O54909 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rdh16O54909 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rdh16O54909 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rdh16O54909 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rdh16O54909 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rdh16O54909 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Rdh16O54909 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rdh16O54909 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rdh16O54909 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Rdh16O54909 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Rdh16O54909 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rdh16O54909 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rdh16O54909 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rdh16O54909 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rdh16O54909 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rdh16O54909 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rdh16O54909 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rdh16O54909 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rdh16O54909 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rdh16O54909 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms