Protein–RNA interactions for Protein: O35914

Bnc1, Zinc finger protein basonuclin-1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnc1O35914 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bnc1O35914 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bnc1O35914 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bnc1O35914 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bnc1O35914 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bnc1O35914 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bnc1O35914 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bnc1O35914 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bnc1O35914 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bnc1O35914 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bnc1O35914 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bnc1O35914 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bnc1O35914 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bnc1O35914 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bnc1O35914 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bnc1O35914 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bnc1O35914 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Bnc1O35914 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bnc1O35914 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bnc1O35914 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Bnc1O35914 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bnc1O35914 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bnc1O35914 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bnc1O35914 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bnc1O35914 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Bnc1O35914 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bnc1O35914 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Bnc1O35914 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bnc1O35914 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Bnc1O35914 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bnc1O35914 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bnc1O35914 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bnc1O35914 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bnc1O35914 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bnc1O35914 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Bnc1O35914 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bnc1O35914 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bnc1O35914 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bnc1O35914 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bnc1O35914 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bnc1O35914 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bnc1O35914 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bnc1O35914 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bnc1O35914 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bnc1O35914 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bnc1O35914 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bnc1O35914 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bnc1O35914 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bnc1O35914 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bnc1O35914 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bnc1O35914 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bnc1O35914 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Bnc1O35914 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Bnc1O35914 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Bnc1O35914 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Bnc1O35914 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Bnc1O35914 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Bnc1O35914 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Bnc1O35914 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Bnc1O35914 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Bnc1O35914 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Bnc1O35914 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Bnc1O35914 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Bnc1O35914 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Bnc1O35914 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Bnc1O35914 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Bnc1O35914 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Bnc1O35914 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Bnc1O35914 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Bnc1O35914 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Bnc1O35914 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Bnc1O35914 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Bnc1O35914 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Bnc1O35914 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Bnc1O35914 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Bnc1O35914 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Bnc1O35914 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Bnc1O35914 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Bnc1O35914 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Bnc1O35914 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Bnc1O35914 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Bnc1O35914 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Bnc1O35914 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Bnc1O35914 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Bnc1O35914 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Bnc1O35914 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Bnc1O35914 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Bnc1O35914 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Bnc1O35914 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Bnc1O35914 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Bnc1O35914 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Bnc1O35914 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Bnc1O35914 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Bnc1O35914 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Bnc1O35914 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Bnc1O35914 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Bnc1O35914 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Bnc1O35914 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Bnc1O35914 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Bnc1O35914 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms