Protein–RNA interactions for Protein: O35386

Phyh, Phytanoyl-CoA dioxygenase, peroxisomal, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PhyhO35386 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PhyhO35386 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PhyhO35386 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PhyhO35386 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PhyhO35386 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PhyhO35386 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PhyhO35386 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PhyhO35386 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PhyhO35386 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PhyhO35386 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PhyhO35386 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PhyhO35386 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PhyhO35386 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PhyhO35386 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PhyhO35386 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PhyhO35386 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PhyhO35386 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PhyhO35386 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PhyhO35386 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PhyhO35386 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PhyhO35386 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PhyhO35386 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PhyhO35386 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PhyhO35386 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PhyhO35386 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PhyhO35386 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PhyhO35386 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PhyhO35386 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PhyhO35386 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PhyhO35386 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PhyhO35386 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PhyhO35386 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PhyhO35386 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PhyhO35386 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PhyhO35386 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PhyhO35386 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PhyhO35386 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PhyhO35386 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PhyhO35386 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PhyhO35386 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PhyhO35386 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PhyhO35386 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PhyhO35386 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PhyhO35386 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PhyhO35386 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PhyhO35386 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PhyhO35386 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PhyhO35386 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PhyhO35386 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PhyhO35386 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PhyhO35386 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PhyhO35386 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PhyhO35386 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PhyhO35386 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PhyhO35386 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PhyhO35386 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PhyhO35386 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PhyhO35386 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PhyhO35386 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PhyhO35386 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PhyhO35386 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PhyhO35386 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PhyhO35386 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PhyhO35386 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PhyhO35386 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PhyhO35386 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PhyhO35386 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PhyhO35386 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PhyhO35386 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PhyhO35386 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PhyhO35386 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PhyhO35386 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PhyhO35386 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PhyhO35386 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PhyhO35386 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PhyhO35386 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PhyhO35386 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PhyhO35386 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PhyhO35386 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PhyhO35386 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PhyhO35386 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PhyhO35386 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PhyhO35386 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PhyhO35386 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PhyhO35386 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PhyhO35386 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PhyhO35386 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PhyhO35386 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PhyhO35386 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PhyhO35386 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PhyhO35386 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PhyhO35386 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PhyhO35386 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PhyhO35386 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PhyhO35386 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PhyhO35386 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PhyhO35386 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PhyhO35386 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PhyhO35386 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PhyhO35386 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms