Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
MsmbO08540 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
MsmbO08540 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
MsmbO08540 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
MsmbO08540 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
MsmbO08540 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
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