Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ23

Gm21310, Predicted gene, 21310, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21310J3QQ23 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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