Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
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