Protein–RNA interactions for Protein: I3ITR1

AK157302, MCG50313, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AK157302I3ITR1 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AK157302I3ITR1 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AK157302I3ITR1 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AK157302I3ITR1 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AK157302I3ITR1 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AK157302I3ITR1 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AK157302I3ITR1 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AK157302I3ITR1 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AK157302I3ITR1 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AK157302I3ITR1 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AK157302I3ITR1 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AK157302I3ITR1 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AK157302I3ITR1 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AK157302I3ITR1 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AK157302I3ITR1 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AK157302I3ITR1 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AK157302I3ITR1 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AK157302I3ITR1 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AK157302I3ITR1 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AK157302I3ITR1 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AK157302I3ITR1 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AK157302I3ITR1 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AK157302I3ITR1 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AK157302I3ITR1 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AK157302I3ITR1 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AK157302I3ITR1 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AK157302I3ITR1 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AK157302I3ITR1 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AK157302I3ITR1 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AK157302I3ITR1 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AK157302I3ITR1 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AK157302I3ITR1 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AK157302I3ITR1 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AK157302I3ITR1 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AK157302I3ITR1 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AK157302I3ITR1 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AK157302I3ITR1 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AK157302I3ITR1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AK157302I3ITR1 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AK157302I3ITR1 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AK157302I3ITR1 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AK157302I3ITR1 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AK157302I3ITR1 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AK157302I3ITR1 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AK157302I3ITR1 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AK157302I3ITR1 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AK157302I3ITR1 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms