Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms